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忍者，原本只是一种对于“忍术修炼者”的称呼，而某些自成派系的“忍术修炼者”本身就拥有众多门下弟子。这些“忍术修炼者”自己本身或门下弟子私底下就利用自己所习得的“忍术”培养了属于个人所拥有的“专属私人部队”，开始以企业化及军事化的经营理念方式管理，时而得受予金钱成为职业杀手雇佣兵，也时而受雇于政府单位部门执行敌后任务。
到后来因为政府单位以投资报酬率及投资风险的角度眼光去分析及评估，发现忍者的战略价值、任务效率以及忠诚度高于一般的间谍及杀手，所以“忍者”到后期就逐渐受到政府单位的重视，也因此开始有了属于政府官方的专属忍者部队。
“忍者”与“间谍”一样，都是属“特种作战层级”的组织。但忍者不一样的地方就是除了本质学能上要受一般的间谍基本训练外，其最为不同之处在于多了一项就是“忍术”的训练。（忍者就是拥有忍术技法之特战层级的单位所培养出来的终极战士。）任务形态更为复杂，更加不单纯，比一般间谍层次更高。这就是所谓的“忍者”。
许多人印象中总以为忍者每次出任务都是以黑衣蒙面的姿态出现，其实是受到武侠小说和电影过分夸张的“物像化”错误影响。的确，这种黑色的衣服确实是忍者出任务时经常穿著的服饰，但也是要看任务状况而定，这种黑色的衣服也并不是所谓的“忍者制服”。事实上古代日本的老百姓在工作时也经常穿著这种黑色的工作衣，那不过是一种日本古代的工作衣罢了。只是因为当忍者在暗夜人静时能方便执行任务上的隐秘需求，才特别穿著这种染黑的工作衣，而在工作衣上有特别的一些修改，以符合任务及作战上的需求。
真正的忍者在出任务时才不会像小说和电影所叙述的总是以黑衣蒙面的姿态出现，真正的忍者在出任务时通常都是化妆成各式各样的社会人士或各行各业的角色混入一般人群之中，作为自我身份的掩饰。例如乞丐、化缘和尚、技艺杂耍表演人、路边小贩、武士、浪人、修道士、江湖郎中等等不定的角色。跟现代的情报员、特务的形态是一样的。
[编辑本段]一个忍者的修炼之路
忍术在日本战国时代盛行一时是因为其极强的实用性。忍术是古代日本忍者所掌握的整套完善的间谍情报技术体系，包括有：追踪、侦察、谍报、保镖、暗杀等多方面的内容。忍者技艺超人，擅长使用剑、钩等各种兵器与飞镖等暗器；他们能飞檐走壁，在沙地上飞跑不发出一点声响；在水中屏息可长达五分钟，如用特殊器具可在水底待上一天一夜；他们善于在水面和水底搏斗，甚至能潜到船底，偷听船上人的对话……这种种的超人技能是通过非人的磨练才能习得的。
忍术的训练要求必须从小开始，凡忍者家族成员，不拘男女老幼，均须无条件的继承这一家庭职业传统（忍术训练），就忍术训练内容来看，其基本训练主要包括平衡、灵敏、力量、持久以及特殊技巧五个方面。
平衡训练：首先从走竹竿开始，至能立于滚圆竹竿上而不滑倒；将竹竿升离地面三尺左右，继续走竹竿，练到行动自如；继续增高竹竿高度，直至三四十尺高度民主，至此身不畏高，翻腾跳扎，如履平地。具备这样的平衡能力后，才能在屋顶、墙头及树木上行走如飞。
灵敏训练：训练从幼年开始，多进行灵敏素质专项训练，如跳过插满刀片的绳子，训练后期做危险障碍跑，跑步途中布满许多危险的障碍物，身法稍有不灵或反映略有不敏，即受障碍物致伤。因此，忍术的灵敏要求十分严格。